泉州还将争取早日开通至台湾高雄港、基隆港支线，扩大与台湾在建材、农副产品和粮食等方面的经贸交流与合作，努力把泉州港建设成为对台直航的重要港口，同时争取设立“泉台自由贸易区”、“海峡两岸共同市场泉州先行区”。支持石井建立对台小额商品交易市场，做大做强福建闽台农产品交易市场，做好按作业区建立对台物流园区，或按分货类建立专门交易市场的前期工作，推进对台小额贸易向规模化方向发展。

　　建设航道为迎台湾大型船舶做准备

　　目前，泉州港口在与金、马、澎的直接往来上有一定基础，但两岸“大三通”后，政策和地缘优势不再，泉州必须加大资金投入，加快泉州湾深水航道、湄洲湾航道二期工程和围头湾通海航道工程建设步伐，有效提升航道通航等级，为承接台湾大型船舶的到来做好准备。

　　结合港口功能定位，泉州将重点做好与台湾高雄、基隆和台中三港的直航对接工作：与高雄、基隆以集装箱为主的直航贸易，必须及早开工建设石湖作业区5#、6#泊位；与台中以大宗谷类、肥料等散货运输为主的直航贸易，必须在建设好肖厝作业区4#泊位的基础上，做好5#至10#泊位项目的前期工作。目前，要抓住小额贸易“双开放”有利时机，整合石井、围头、深沪、梅林作业区的对台业务，加快建设或规定对台货运和小额贸易专用码头泊位，提高对台贸易专用泊位的等级。